Учёные создали новый алгоритм для прогнозирования развития рака

Татьяна Новак

Группа учёных разработала вычислительный метод для прогнозирования развития рака. Они считают, что он позволит лучше понять причины, стимулирующие развитие болезни, и найти эффективные способы лечения. Об этом пишет Science Daily.

Новая система моделирования под названием PiCnIc (Pipeline for Cancer Inference), использует данные о последовательностях генов, чтобы вычислить, при каких условиях начинается развитие опухоли. С её помощью учёные исследуют взаимосвязь между злокачественными мутациями и определёнными условиями, такими как недостаток кислорода, подвижности клеток или снижения иммунитета.

Ранее считалось, что развитие рака начинается с одной «неправильной» клетки и распространяется, в частности, за счёт неконтролируемого деления клеток, с которыми не справляются гены-супрессоры — гены, белковые продукты которых подавляют образование опухоли. Тем не менее, в последние годы исследования показали более сложную картину роста рака. В частности, немаловажным оказалось и взаимодействие между клетками опухолей, клеточный состав которой оказался довольно неоднородным. Алгоритм PiCnIc обращает внимание на функцию мутаций-драйверов, которые подстегивают прогрессирование рака, а также то, как одна мутация-драйвер влияет на другую в течение долгого времени.

Алгоритм PiCnIc изучает мутации-драйверы и их взаимодействие. Иллюстрация:PiCnIc

«Мы предлагаем биоинформатический анализ для выявления общих закономерностей в возникновении и развитии опухолей. Это может быть ключевым шагом к пониманию заболевания, характеризующегося рядом общих геномных поражений у разных пациентов», — говорит соавтор исследования Джулио Гаравагна.

Исследование провели сотрудники Курантовского института математических наук из Университета Нью-Йорка, Школы информатики и Университете Эдинбурга, а также специалисты из нескольких онкологических центров. Полный текст исследования опубликовал PNAS.

Ранее учёные обучили нейросеть находить раковые клетки в образцах крови.

Загрузить еще